Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms