Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRP9P49458 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP9P49458 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP9P49458 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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