Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms