Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms