Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CCDC142Q17RM4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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