Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TMEM258P61165 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms