Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms