Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMC1P11047 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms