Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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