RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.32■■■■□ 3.08
SEPHS1-201ENST00000327347 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.26■■■□□ 2.43
SEPHS1-201ENST00000327347 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
SEPHS1-201ENST00000327347 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.25■■■□□ 2.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
SEPHS1-201ENST00000327347 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.82■■■□□ 2.2
SEPHS1-201ENST00000327347 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.81■■■□□ 2.2
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.68■■■□□ 2.18
SEPHS1-201ENST00000327347 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.65■■■□□ 2.18
SEPHS1-201ENST00000327347 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
SEPHS1-201ENST00000327347 HRCP23327 699 aa28.48■■■□□ 2.15
SEPHS1-201ENST00000327347 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.28■■■□□ 2.12
SEPHS1-201ENST00000327347 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.9■■■□□ 2.06
SEPHS1-201ENST00000327347 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.8■■■□□ 2.04
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
SEPHS1-201ENST00000327347 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
SEPHS1-201ENST00000327347 TRIM41Q8WV44 630 aa27.52■■■□□ 2
SEPHS1-201ENST00000327347 SCRIBQ14160 1630 aa27.51■■□□□ 1.99
SEPHS1-201ENST00000327347 ABCC9O60706 1549 aa27.44■■□□□ 1.98
SEPHS1-201ENST00000327347 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
SEPHS1-201ENST00000327347 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.24■■□□□ 1.95
SEPHS1-201ENST00000327347 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.03■■□□□ 1.92
SEPHS1-201ENST00000327347 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SEPHS1-201ENST00000327347 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SEPHS1-201ENST00000327347 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SEPHS1-201ENST00000327347 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.86■■□□□ 1.89
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SEPHS1-201ENST00000327347 WIZO95785 1651 aa26.74■■□□□ 1.87
SEPHS1-201ENST00000327347 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SEPHS1-201ENST00000327347 NACADO15069 1562 aa26.59■■□□□ 1.85
SEPHS1-201ENST00000327347 NEUROD1Q13562 356 aa26.43■■□□□ 1.82
SEPHS1-201ENST00000327347 ABCC8Q09428 1581 aa26.41■■□□□ 1.82
SEPHS1-201ENST00000327347 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.34■■□□□ 1.81
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SEPHS1-201ENST00000327347 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.3■■□□□ 1.8
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SEPHS1-201ENST00000327347 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SEPHS1-201ENST00000327347 SOGA1O94964 1423 aa26.25■■□□□ 1.79
SEPHS1-201ENST00000327347 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SEPHS1-201ENST00000327347 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SEPHS1-201ENST00000327347 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SEPHS1-201ENST00000327347 CEP162Q5TB80 1403 aa26.19■■□□□ 1.78
SEPHS1-201ENST00000327347 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
SEPHS1-201ENST00000327347 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.14■■□□□ 1.77
SEPHS1-201ENST00000327347 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SEPHS1-201ENST00000327347 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.1■■□□□ 1.77
SEPHS1-201ENST00000327347 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SEPHS1-201ENST00000327347 SMARCA2P51531 1590 aa26.05■■□□□ 1.76
SEPHS1-201ENST00000327347 SMARCA4P51532 1647 aa26.05■■□□□ 1.76
SEPHS1-201ENST00000327347 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SEPHS1-201ENST00000327347 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.98■■□□□ 1.75
SEPHS1-201ENST00000327347 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
SEPHS1-201ENST00000327347 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SEPHS1-201ENST00000327347 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.81■■□□□ 1.72
SEPHS1-201ENST00000327347 GOLGA3Q08378 1498 aa25.79■■□□□ 1.72
SEPHS1-201ENST00000327347 EEA1Q15075 1411 aa25.75■■□□□ 1.71
SEPHS1-201ENST00000327347 APLP2Q06481 763 aa25.68■■□□□ 1.7
SEPHS1-201ENST00000327347 MIER1Q8N108 512 aa25.65■■□□□ 1.7
SEPHS1-201ENST00000327347 CLIP1P30622 1438 aa25.65■■□□□ 1.7
SEPHS1-201ENST00000327347 SYNJ1O43426 1573 aa25.61■■□□□ 1.69
SEPHS1-201ENST00000327347 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.57■■□□□ 1.68
SEPHS1-201ENST00000327347 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.53■■□□□ 1.68
SEPHS1-201ENST00000327347 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.52■■□□□ 1.68
SEPHS1-201ENST00000327347 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.46■■□□□ 1.67
SEPHS1-201ENST00000327347 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SEPHS1-201ENST00000327347 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.39■■□□□ 1.66
SEPHS1-201ENST00000327347 KIF21BO75037 1637 aa25.38■■□□□ 1.65
SEPHS1-201ENST00000327347 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SEPHS1-201ENST00000327347 ITGAEP38570 1179 aa25.31■■□□□ 1.64
SEPHS1-201ENST00000327347 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.29■■□□□ 1.64
SEPHS1-201ENST00000327347 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SEPHS1-201ENST00000327347 BCANQ96GW7 911 aa25.13■■□□□ 1.61
SEPHS1-201ENST00000327347 ARAP1Q96P48 1450 aa25.09■■□□□ 1.61
SEPHS1-201ENST00000327347 TOP2BQ02880 1626 aa25.09■■□□□ 1.61
SEPHS1-201ENST00000327347 PRXQ9BXM0 1461 aa25.01■■□□□ 1.59
SEPHS1-201ENST00000327347 KCNH8Q96L42 1107 aa24.97■■□□□ 1.59
SEPHS1-201ENST00000327347 CUX1P39880 1505 aa24.94■■□□□ 1.58
SEPHS1-201ENST00000327347 KIF27Q86VH2 1401 aa24.93■■□□□ 1.58
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SEPHS1-201ENST00000327347 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.9■■□□□ 1.58
SEPHS1-201ENST00000327347 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.9■■□□□ 1.58
SEPHS1-201ENST00000327347 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.9■■□□□ 1.58
SEPHS1-201ENST00000327347 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.89■■□□□ 1.58
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SEPHS1-201ENST00000327347 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.84■■□□□ 1.57
SEPHS1-201ENST00000327347 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SEPHS1-201ENST00000327347 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SEPHS1-201ENST00000327347 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.79■■□□□ 1.56
SEPHS1-201ENST00000327347 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.78■■□□□ 1.56
SEPHS1-201ENST00000327347 CUX2O14529 1486 aa24.74■■□□□ 1.55
SEPHS1-201ENST00000327347 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SEPHS1-201ENST00000327347 NCAPD3P42695 1498 aa24.71■■□□□ 1.55
SEPHS1-201ENST00000327347 IGF1RP08069 1367 aa24.68■■□□□ 1.54
SEPHS1-201ENST00000327347 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.67■■□□□ 1.54
SEPHS1-201ENST00000327347 CFTRP13569 1480 aa24.66■■□□□ 1.54
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