Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD1Q9NXG2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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