Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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CLCA4Q14CN2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CLCA4Q14CN2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CLCA4Q14CN2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CLCA4Q14CN2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CLCA4Q14CN2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CLCA4Q14CN2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CLCA4Q14CN2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CLCA4Q14CN2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLCA4Q14CN2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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