Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms