Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms