Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ZNF185-203ENST00000324823 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARNTL-208ENST00000482049 739 ntTSL 38.96□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CHMP4A-205ENST00000531158 563 ntTSL 48.95□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 KANK1-201ENST00000354485 6912 ntTSL 28.85□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 HSPD1-211ENST00000476746 853 ntTSL 28.78□□□□□ -12e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SETD5-208ENST00000421188 1323 ntTSL 58.76□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GAB2-205ENST00000528886 543 ntTSL 48.73□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NECAP1-202ENST00000450991 2446 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CEACAM19-206ENST00000592789 475 ntTSL 28.6□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CEACAM19-207ENST00000618372 972 ntTSL 58.6□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CEACAM19-205ENST00000591979 608 ntTSL 28.6□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NECAP1-212ENST00000638787 2067 ntTSL 58.57□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 MCTP2-206ENST00000556363 4374 ntTSL 58.56□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NECAP1-224ENST00000640099 3313 ntTSL 58.17□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 LIMA1-213ENST00000552720 2457 ntTSL 1 (best)8.11□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NECAP1-204ENST00000540083 863 ntTSL 58.11□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SETD5-202ENST00000399686 3362 ntTSL 57.94□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NECAP1-203ENST00000537796 3418 ntTSL 57.9□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 MIR4435-2HG-205ENST00000431385 843 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SETD5-206ENST00000413704 3428 ntTSL 27.8□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SETD5-228ENST00000493918 4861 ntTSL 1 (best)7.68□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 PSD3-212ENST00000520789 750 ntTSL 37.65□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NECAP1-213ENST00000638883 3940 ntTSL 57.63□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 HSPD1-209ENST00000452200 888 ntTSL 57.51□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 HSPD1-210ENST00000461097 714 ntTSL 27.51□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.223e-9■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 TM7SF3-215ENST00000543882 762 ntTSL 57.34□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CHMP4A-209ENST00000542700 847 ntTSL 37.2□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NECAP1-226ENST00000640481 3216 ntTSL 57.2□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NECAP1-220ENST00000639841 1982 ntTSL 57.18□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NECAP1-208ENST00000545807 3113 ntTSL 57.07□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NECAP1-222ENST00000640072 3456 ntTSL 57.02□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NECAP1-205ENST00000541948 728 ntTSL 57□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SETD5-217ENST00000466242 4038 ntTSL 26.98□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 RAPGEF4-207ENST00000466030 493 ntTSL 36.92□□□□□ -1.33e-9■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CHMP4A-210ENST00000552620 716 ntTSL 26.56□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NFE2L2-209ENST00000458603 455 ntTSL 36.42□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 HSPD1-204ENST00000426480 529 ntTSL 46.39□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 UBR3-204ENST00000430321 5411 ntTSL 56.22□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 AC093752.1-208ENST00000498873 981 ntTSL 56.2□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 HSPD1-208ENST00000440114 619 ntTSL 56.09□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 AC009119.2-203ENST00000566309 583 ntTSL 26.05□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 REPS2-203ENST00000469714 711 ntTSL 35.99□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.453e-9■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 RAD51B-203ENST00000468382 829 ntTSL 55.92□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ITGB1BP1-213ENST00000482798 564 ntTSL 45.57□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 HSPD1-206ENST00000430176 754 ntTSL 55.48□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 TM7SF3-217ENST00000545303 541 ntTSL 34.93□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.642e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARNTL-218ENST00000531665 390 ntTSL 54.74□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CEACAM19-208ENST00000619799 828 ntTSL 54.64□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 TNFSF10-203ENST00000430881 467 ntTSL 54.52□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 DCP1A-203ENST00000559748 581 ntTSL 34.38□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 UBR3-202ENST00000392632 5129 ntTSL 54.27□□□□□ -1.732e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GSTA1-202ENST00000476213 460 ntTSL 53.75□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CD96-207ENST00000494798 2039 ntTSL 23.64□□□□□ -1.832e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.842e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 UBR3-209ENST00000477461 595 ntTSL 43.38□□□□□ -1.872e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 HSPD1-213ENST00000486181 648 ntTSL 22.54□□□□□ -22e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.012e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARNTL-216ENST00000529825 551 ntTSL 42.45□□□□□ -2.022e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CHMP4A-208ENST00000534106 370 ntTSL 52.42□□□□□ -2.022e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 RAD51B-213ENST00000492236 417 ntTSL 32.22□□□□□ -2.052e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 C1orf21-204ENST00000489143 426 ntTSL 51.56□□□□□ -2.162e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.22e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.52e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 DGKG-205ENST00000447054 295 ntTSL 39.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 POLR3E-211ENST00000564750 2327 ntTSL 218.6■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 28.8
DGCR8Q8WYQ5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-7■■■■■ 28.7
DGCR8Q8WYQ5 GDI2-206ENST00000456041 918 ntTSL 511.68□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 28.7
DGCR8Q8WYQ5 GDI2-202ENST00000380181 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 28.7
DGCR8Q8WYQ5 GDI2-205ENST00000447751 834 ntTSL 33.34□□□□□ -1.872e-7■■■■■ 28.7
DGCR8Q8WYQ5 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)23.87■■□□□ 1.415e-8■■■■■ 28.6
DGCR8Q8WYQ5 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)23.87■■□□□ 1.415e-8■■■■■ 28.6
DGCR8Q8WYQ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.275e-8■■■■■ 28.6
DGCR8Q8WYQ5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.15e-8■■■■■ 28.6
DGCR8Q8WYQ5 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)20.38■□□□□ 0.855e-8■■■■■ 28.6
DGCR8Q8WYQ5 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 517.32■□□□□ 0.365e-8■■■■■ 28.6
DGCR8Q8WYQ5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 28.6
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