Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMC5Q6UXY8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms