Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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