Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SELENBP1Q13228 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SELENBP1Q13228 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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