Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2A1P52655 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms