Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMARCA4P51532 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms