Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04436 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P04436 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P04436 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P04436 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P04436 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P04436 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04436 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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P04436 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P04436 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P04436 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P04436 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P04436 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04436 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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