Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POP4O95707 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms