Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TTLL13PA6NNM8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL13PA6NNM8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL13PA6NNM8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL13PA6NNM8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL13PA6NNM8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL13PA6NNM8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms