Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3AQ9Y6K1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms