Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PADI3Q9ULW8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PADI3Q9ULW8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PADI3Q9ULW8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PADI3Q9ULW8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PADI3Q9ULW8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PADI3Q9ULW8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PADI3Q9ULW8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PADI3Q9ULW8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PADI3Q9ULW8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PADI3Q9ULW8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PADI3Q9ULW8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PADI3Q9ULW8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PADI3Q9ULW8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PADI3Q9ULW8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PADI3Q9ULW8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PADI3Q9ULW8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
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