Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MSRAQ9UJ68 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MSRAQ9UJ68 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms