Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFP1

FAM198A, Protein FAM198A, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198AQ9UFP1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM198AQ9UFP1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FAM198AQ9UFP1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM198AQ9UFP1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM198AQ9UFP1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM198AQ9UFP1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM198AQ9UFP1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms