Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDP2Q9P2J9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDP2Q9P2J9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDP2Q9P2J9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDP2Q9P2J9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms