Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMCD1Q9NZU5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMCD1Q9NZU5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms