Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXC10Q9NYD6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC10Q9NYD6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC10Q9NYD6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms