Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCFC1R1Q9NWW0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCFC1R1Q9NWW0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCFC1R1Q9NWW0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HCFC1R1Q9NWW0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCFC1R1Q9NWW0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCFC1R1Q9NWW0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCFC1R1Q9NWW0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCFC1R1Q9NWW0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCFC1R1Q9NWW0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCFC1R1Q9NWW0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCFC1R1Q9NWW0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCFC1R1Q9NWW0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCFC1R1Q9NWW0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCFC1R1Q9NWW0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCFC1R1Q9NWW0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCFC1R1Q9NWW0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms