Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTG1Q9NSN8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms