Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7P6

MVB12B, Multivesicular body subunit 12B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12BQ9H7P6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MVB12BQ9H7P6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MVB12BQ9H7P6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MVB12BQ9H7P6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MVB12BQ9H7P6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12BQ9H7P6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12BQ9H7P6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12BQ9H7P6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12BQ9H7P6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12BQ9H7P6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12BQ9H7P6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12BQ9H7P6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12BQ9H7P6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12BQ9H7P6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MVB12BQ9H7P6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms