Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRADC1Q9BSG0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRADC1Q9BSG0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRADC1Q9BSG0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRADC1Q9BSG0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRADC1Q9BSG0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms