Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HHIPQ96QV1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HHIPQ96QV1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms