Protein–RNA interactions for Protein: Q96I24

FUBP3, Far upstream element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP3Q96I24 VGLL4-201ENST00000273038 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 20.1
FUBP3Q96I24 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.357e-9■■■■□ 20.1
FUBP3Q96I24 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.287e-9■■■■□ 20.1
FUBP3Q96I24 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.067e-9■■■■□ 20.1
FUBP3Q96I24 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.56e-11■■■■□ 20.1
FUBP3Q96I24 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.621e-11■■■■□ 20.1
FUBP3Q96I24 EEF1E1-204ENST00000502429 591 ntTSL 39.33□□□□□ -0.921e-11■■■■□ 20.1
FUBP3Q96I24 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.481e-11■■■■□ 20.1
FUBP3Q96I24 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.641e-11■■■■□ 20.1
FUBP3Q96I24 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.173e-7■■■■□ 20.1
FUBP3Q96I24 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.123e-7■■■■□ 20.1
FUBP3Q96I24 TRIM33-206ENST00000492227 355 ntTSL 26.36□□□□□ -1.399e-11■■■■□ 20.1
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.595e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.55e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-218ENST00000636639 2125 ntTSL 1 (best)18.05■□□□□ 0.485e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.425e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.295e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.285e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-216ENST00000636574 2027 ntTSL 516.71■□□□□ 0.275e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.255e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-219ENST00000636787 2012 ntTSL 516.29■□□□□ 0.25e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.25e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-209ENST00000635774 1995 ntTSL 515.94■□□□□ 0.145e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.15e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-208ENST00000635734 1851 ntTSL 515.09■□□□□ 0.015e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 ATP6AP2-210ENST00000635829 2479 ntTSL 57.52□□□□□ -1.215e-10■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.222e-11■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.293e-14■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 RBX1-202ENST00000467617 1871 ntTSL 214.59□□□□□ -0.073e-14■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 AC140504.1-201ENST00000568766 498 ntAPPRIS P1 TSL 225.13■■□□□ 1.612e-8■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.742e-8■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 AC140504.1-203ENST00000567442 476 ntTSL 218.11■□□□□ 0.492e-8■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.282e-8■■■■□ 20
FUBP3Q96I24 AC012065.3-201ENST00000602736 439 ntBASIC7.5□□□□□ -1.213e-9■■■■□ 19.9
FUBP3Q96I24 G2E3-207ENST00000549159 3224 ntTSL 1 (best)4.8□□□□□ -1.644e-10■■■■□ 19.9
FUBP3Q96I24 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.14e-7■■■■□ 19.9
FUBP3Q96I24 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.24e-7■■■■□ 19.9
FUBP3Q96I24 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.724e-7■■■■□ 19.9
FUBP3Q96I24 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.794e-7■■■■□ 19.9
FUBP3Q96I24 SLC2A3-205ENST00000486749 4414 ntTSL 1 (best)8.72□□□□□ -1.016e-9■■■■□ 19.9
FUBP3Q96I24 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.076e-9■■■■□ 19.9
FUBP3Q96I24 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.242e-6■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 HNF4A-207ENST00000609262 540 ntTSL 1 (best)18.9■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 HNF4A-203ENST00000372920 3340 ntTSL 1 (best)17.69■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 HNF4A-209ENST00000619550 4763 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.571e-7■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.861e-7■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.394e-12■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.992e-6■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.512e-6■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.215e-7■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 CHAMP1-201ENST00000361283 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.54e-9■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 PPP2CB-209ENST00000523023 448 ntTSL 37.17□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 19.8
FUBP3Q96I24 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-9■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.495e-7■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.759e-11■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.032e-8■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-8■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-7■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-7■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.791e-7■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 SERINC1-201ENST00000339697 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.733e-8■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.12e-6■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.122e-6■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.152e-6■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.232e-6■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)6.93□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.076e-7■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.716e-7■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.676e-7■■■■□ 19.7
FUBP3Q96I24 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-15■■■■□ 19.6
FUBP3Q96I24 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.681e-6■■■■□ 19.6
FUBP3Q96I24 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 19.6
FUBP3Q96I24 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 19.6
FUBP3Q96I24 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.433e-7■■■■□ 19.6
FUBP3Q96I24 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.693e-7■■■■□ 19.6
FUBP3Q96I24 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.563e-7■■■■□ 19.6
FUBP3Q96I24 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.563e-7■■■■□ 19.6
FUBP3Q96I24 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.133e-7■■■■□ 19.6
FUBP3Q96I24 SERPINE2-203ENST00000409840 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -13e-7■■■■□ 19.6
FUBP3Q96I24 SERPINE2-208ENST00000473202 5989 ntTSL 28.7□□□□□ -1.023e-7■■■■□ 19.6
FUBP3Q96I24 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.672e-13■■■■□ 19.6
FUBP3Q96I24 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.926e-6■■■■□ 19.6
FUBP3Q96I24 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.094e-7■■■■□ 19.5
FUBP3Q96I24 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.24e-7■■■■□ 19.5
FUBP3Q96I24 RAB18-201ENST00000356940 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.714e-7■■■■□ 19.5
FUBP3Q96I24 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.534e-7■■■■□ 19.5
FUBP3Q96I24 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.956e-13■■■■□ 19.5
FUBP3Q96I24 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.916e-13■■■■□ 19.5
FUBP3Q96I24 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.176e-13■■■■□ 19.5
Retrieved 100 of 4,568 protein–RNA pairs in 336.6 ms