Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNRQ92752 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNRQ92752 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNRQ92752 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNRQ92752 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNRQ92752 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNRQ92752 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNRQ92752 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNRQ92752 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNRQ92752 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TNRQ92752 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TNRQ92752 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TNRQ92752 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TNRQ92752 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNRQ92752 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNRQ92752 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNRQ92752 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNRQ92752 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNRQ92752 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNRQ92752 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNRQ92752 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
TNRQ92752 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNRQ92752 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNRQ92752 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNRQ92752 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNRQ92752 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNRQ92752 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNRQ92752 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNRQ92752 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNRQ92752 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNRQ92752 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
TNRQ92752 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNRQ92752 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNRQ92752 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNRQ92752 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNRQ92752 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNRQ92752 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TNRQ92752 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
TNRQ92752 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
TNRQ92752 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNRQ92752 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNRQ92752 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNRQ92752 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNRQ92752 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNRQ92752 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNRQ92752 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNRQ92752 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNRQ92752 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TNRQ92752 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TNRQ92752 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TNRQ92752 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TNRQ92752 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TNRQ92752 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TNRQ92752 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNRQ92752 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
TNRQ92752 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNRQ92752 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNRQ92752 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNRQ92752 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNRQ92752 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNRQ92752 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNRQ92752 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TNRQ92752 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TNRQ92752 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TNRQ92752 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TNRQ92752 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TNRQ92752 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TNRQ92752 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
TNRQ92752 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TNRQ92752 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TNRQ92752 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TNRQ92752 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TNRQ92752 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TNRQ92752 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TNRQ92752 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TNRQ92752 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TNRQ92752 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TNRQ92752 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TNRQ92752 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TNRQ92752 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TNRQ92752 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TNRQ92752 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TNRQ92752 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TNRQ92752 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TNRQ92752 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNRQ92752 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNRQ92752 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNRQ92752 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNRQ92752 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNRQ92752 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNRQ92752 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNRQ92752 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNRQ92752 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNRQ92752 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNRQ92752 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNRQ92752 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNRQ92752 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNRQ92752 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TNRQ92752 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNRQ92752 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms