Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERVK_113Q902F9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms