Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC41

RNF217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF217Q8TC41 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF217Q8TC41 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF217Q8TC41 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF217Q8TC41 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms