Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP38Q8NB14 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP38Q8NB14 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP38Q8NB14 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms