Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LNX2Q8N448 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LNX2Q8N448 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LNX2Q8N448 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LNX2Q8N448 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LNX2Q8N448 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LNX2Q8N448 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LNX2Q8N448 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LNX2Q8N448 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LNX2Q8N448 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LNX2Q8N448 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LNX2Q8N448 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LNX2Q8N448 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LNX2Q8N448 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LNX2Q8N448 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LNX2Q8N448 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LNX2Q8N448 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LNX2Q8N448 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LNX2Q8N448 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LNX2Q8N448 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LNX2Q8N448 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LNX2Q8N448 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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