Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPC2Q8N158 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPC2Q8N158 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC2Q8N158 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms