Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL2

SFTPA1, Pulmonary surfactant-associated protein A1, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA1Q8IWL2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFTPA1Q8IWL2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFTPA1Q8IWL2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFTPA1Q8IWL2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms