Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SRGAP1Q7Z6B7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRGAP1Q7Z6B7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRGAP1Q7Z6B7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SRGAP1Q7Z6B7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SRGAP1Q7Z6B7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRGAP1Q7Z6B7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRGAP1Q7Z6B7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRGAP1Q7Z6B7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRGAP1Q7Z6B7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRGAP1Q7Z6B7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms