Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP1BQ7LBR1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms