Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP50Q70EL3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP50Q70EL3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP50Q70EL3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms