Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF43Q68DV7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF43Q68DV7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms