Protein–RNA interactions for Protein: Q68CR1

SEL1L3, Protein sel-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1L3Q68CR1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEL1L3Q68CR1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEL1L3Q68CR1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms