Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF3Q5VWG9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TAF3Q5VWG9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms