Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM240Q5SV17 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM240Q5SV17 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms